По итогам независимой оценки качества актуализации программ инновационного развития в 2016 году, утвержденной Межведомственной рабочей группой по реализации приоритетов инновационного развития президиума Совета при Президенте Российской Федерации по модернизации экономики и инновационному развитию России, Системный оператор вошел в первую тройку рейтинга организаций, входящих в группу 2 утвержденного Правительством РФ Перечня компаний с государственным участием.

К группе 2 относятся компании, в отношении которых мониторинг программ инновационного развития (ПИР) реализуется федеральными органами исполнительной власти. Помимо Системного оператора в рейтинге приняли участие такие компании этой группы, как ПАО «ФСК ЕЭС», АО «Объединенная двигателестроительная корпорация», АО «Концерн «ЦНИИ «Электроприбор», АО «НПК «Техмаш» и другие.

В процессе оценки актуализированных программ инновационного развития госкомпаний эксперты учитывали обоснованность и достижимость целей и ключевых показателей эффективности (КПЭ) инновационного развития, качество анализа и прогноза в инновационной сфере, наличие долгосрочного видения, новизну и значимость для компании ключевых инновационных проектов, достаточную обеспеченность финансовыми ресурсами для достижения целей и т.д.

Системный оператор актуализировал свою Программу инновационного развития на 2012–2016 годы и на перспективу до 2020 года и разработал новую Программу инновационного развития на 2016–2020 годы и на перспективу до 2025 года. Основой для ее разработки стали документы, определяющие приоритетные направления научно-технического прогресса в энергетическом секторе, в первую очередь – Стратегия инновационного развития РФ, Энергетическая стратегия России и Прогноз научно-технологического развития РФ на период до 2030 года.

Актуализированная программа инновационного развития Системного оператора, утвержденная Советом Директоров компании 19 апреля 2016 года, уделяет большое внимание развитию технологий централизованного диспетчерского управления электроэнергетическим режимом ЕЭС России, совершенствованию инструментов оперативно-диспетчерского управления, а также современных рыночных механизмов, средств поддержания требуемого уровня надежности и другим инновационным направлениям.